Dijkstra is sinds haar promotie in 2009 actief als onderzoeker. Ze richt zich onder andere op vraagstukken waarin omgevingspsychologie en de zorgomgeving centraal staat. Dijkstra heeft gewerkt aan Plymouth University in Engeland en als universitair docent bij Klinische Psychologie aan de VU Amsterdam.
Binnen Saxion werkt Dijkstra aan verschillende onderzoeksprojecten, onder andere aan projecten waarin gekeken wordt naar hoe technologie ingezet kan worden ter ondersteuning van het gezonder oud worden (healthy ageing) van ouderen met een migratieachtergrond.
Binnen het SPRONG Programma HealthTech in Society coördineert Karin Dijkstra de leergemeenschap rondom het voorkomen van zorg.